По сути когда у вас домен, время должно распространятся от корневого контролера — вниз до обычных хостов.
Корневой PDC может синхронизировать свое время как со внешним источником, так и с самим собой, последнее задано конфигурацией по умолчанию и является абсурдом, о чем периодически намекают ошибки в системном журнале.
Синхронизация клиентов корневого PDC может осуществятся как с его внутренних часов, так и с внешнего источника. В первом случае сервер времени корневого PDC объявляет себя как «надежный» (reliable).

Конфигурация NTP-сервера на корневом PDC
Конфигурирование сервера времени (NTP-сервера) может осуществляться как с помощью утилиты командной строки w32tm, так и через реестр. Где возможно, я приведу оба варианта.
Открываем ветку реестра:

Здесь в первую очередь нас интересует параметр Type, который задает тип синхронизации. Он может принимать следующие значения:
NoSync— Служба времени не синхронизируется с другими источниками.
NTP— Служба времени выполняет синхронизацию с серверами, указанными в записи реестра NtpServer.
NT5DS— Служба времени выполняет синхронизацию на основе иерархии домена.
AllSync— Служба времени использует все доступные механизмы синхронизации.

В параметре NtpServer указываются NTP-сервера, с которыми будет синхронизировать время данный сервер. По умолчанию в этом параметре прописан NTP-сервер Microsoft (time.windows.com, 0?1), при необходимости можно добавить еще несколько NTP-серверов, введя их DNS имена или IP адреса через пробел. В конце каждого имени можно добавлять флаг (напр. ,0?1) который определяет режим для синхронизации с сервером времени.

Допускаются следующие значения режима:
0?1 – SpecialInterval, использование временного интервала опроса;
0?2 – режим UseAsFallbackOnly;
0?4 – SymmetricActive, симметричный активный режим;
0?8 – Client, отправка запроса в клиентском режиме.

Объявление NTP-сервера в качестве надежного

Включение NTP-сервера

Задание интервала синхронизации с внешним источником
Время в секундах между опросами источника синхронизации, по умолчанию 900с = 15мин. Работает только для источников, помеченных флагом 0?1.

Установка минимальной положительной и отрицательной коррекции
Максимальная положительная и отрицательная коррекция времени (разница между внутренними часами и источником синхронизации) в секундах, при превышении которой синхронизация не происходит. Рекомендую значение 0xFFFFFFFF, при котором коррекция сможет производиться всегда.

После настройки необходимо обновить конфигурацию сервиса. Сделать это можно командой

Можно узнать, насколько системное время данного компьютера отличается от времени на контроллере домена или других компьютерах. Например:

можно заставить компьютер синхронизироваться с используемым им сервером времени.

показывает разницу во времени между текущим и удаленным компьютером. Команда w32tm /stripchart /computer:time.nist.gov /samples:5 /dataonly произведет 5 сравнений с указанным источником и выдаст результат в текстовом виде.

основная команда, используемая для настройки службы NTP. С ее помощью можно задать список используемых серверов времени, тип синхронизации и многое другое. Например, переопределить значения по умолчанию и настроить синхронизацию времени с внешним источником, можно командой w32tm /config /syncfromflags:manual /manualpeerlist:time.nist.gov /update

показывает текущие настройки службы. Например команда w32tm /query /source покажет текущий источник времени, а w32tm /query /configuration выведет все параметры службы.

net stop w32time — останавливает службу времени, если запущена.
w32tm /unregister — удаляет службу времени с компьютера.
w32tm /register – регистрирует службу времени на компьютере. При этом создается заново вся ветка параметров в реестре.
net start w32time — запускает службу.

Особенности виртуализированных контроллеров домена

Контроллеры домена, работающие в виртуализированной среде, требуют к себе особенного отношения.
Средства синхронизации времени виртуальной машины и хостовой ОС должны быть выключены. Во всех адекватных системах виртуализации (Microsoft, vmWare и т. д.) присутствуют компоненты интеграции гостевой ОС с хостовой, которые значительно повышают производительность и управляемость гостевой системой. Среди этих компонентов всегда есть средство синхронизации времени гостевой ОС с хостовой, которое очень полезно для рядовых машин, но противопоказано для контроллеров домена. Потому как в этом случае весьма вероятен цикл, при котором контроллер домена и хостовая ОС будут синхронизировать друг друга. Последствия печальны.
Для корневого PDC синхронизация с внешним источником должна быть настроена всегда. В виртуальной среде часы не настолько точны как в физической, потому как виртуальная машина работает с виртуальным процессором и прерываниями, для которых характерно как замедление, так и ускорение относительно «обычной» частоты. Если не настроить синхронизацию виртуализированного корневого PDC с внешним источником, время на всех компьютерах предприятия может убегать/отставать на пару часов в сутки. Не трудно представить неприятности, которые может принести такое поведение.

Источник1,Источник 2